SNL の論文チェック

今日は、SNL の論文関係の論文を３本チェック。

１．A distributed SDP approach for large-scale noisy anchor-free graph realization with applications to molecular, SIAM Journal on Scientific Computing archive, 30(3), 2008.

これは、この前に読んだ An SDP-based divide-and-conquer algorithm for large scale noisy anchor-free graph realization とほぼ同じ。たぶん、１のものはこれをベースにしているはず。もし、実装するのであれば、両方読むと良い。

2. Learning a Kernel Matrix for Nonlinear Dimensionality Reduction, ACM International Conference Proceeding Series , 69

3. Nonlinear Dimensionality Reduction by Semidefinite Programming and Kernel Matrix Factorization, Proceedings of the Tenth International Workshop on Artificial Intelligence and Statistics

2と3は First author が同じ人で、Kernel trick のときにどれだけ少ない rank でできるか、を SDP で計算する、というもの。
2 の中にある locally isometric の考え方は、今後に応用できそうだ。

あとは、昨日まで読んでいた本のメモ。
読んでいたのは、 「たんぱく質のフォールディング」で、SNL の応用として読んでみたが、完璧にたんぱく質の話で SNL とは距離がある感じだ。
ただ、αへリックスやβストライド、など、特徴的な構造が何回も現れる、というのは面白かった。

明日は、グラフ理論の論文読み。

今日の作業内容: 論文読み 5h
今日のBGM: Xenosaga Episode III OST [1-2]
明日の予測作業時間: 5h