2012年3月16日金曜日

タンパク質とsubmodular

2か月前に取り組んでいた submodular であるが、タンパク質の場合には最密部分グラフをうまく見つけることができなかった。
どうやら、タンパク質は、最も密な部分から最も疎な部分まで、なだらかに密度が減少しており、どこで切るのがベストなのかという判断が難しかった。

今回は、このときに勉強した手法を取り込んで、SNL の特定を行うようにしている。
まだまだ実装中なので結果は分からないが、それなりにうまく行くのではないか、と推測している。

今日の作業内容:submodular 3h
今日のランチ:味庵 油淋鶏
明日の予測作業時間:6h

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